2026年,全球AI4Science赛事进入新阶段:从模型算法竞赛升级为"AI设计—实验验证—反馈优化"的闭环实战。9月下旬中国蛋白质设计赛事三连发——上交大自然科学研究院承办的"长江杯"2026(百万奖池、≥5000条设计免费湿实验)、清华FBS PDC2026(NK2R纳米抗体激动剂)、镁伽科技Poreva Open(万级双盲湿实验基准)相继开闸;10月13日思朗科技宣布以联合发起方身份加盟,科学算力×自主实验室共建;10月18日首轮三题如期发布——条件化 EGFR binder、条件化 TNF-α binder、GLP1R 激动剂,与 Anthropic×Adaptyv 五连挑战前三题高度同源,构成跨生态镜像基准。本页系统汇总中国(长江杯、PDC2026、Poreva Open、SICBC、清华FBS/FRCBS、WSAI)、韩国(第4届 JUMP AI 智能体新药竞赛)与美国/国际(CASP17、CAPRI Round 65、CACHE #8、GEM×Adaptyv、OpenADMET/Polaris、Owkin Rewiring Biology 等)重大赛事的赛道、赛制、奖金与时间节点。
以上海为核心,中国AI4Science赛事已形成"算法竞赛+实验验证+产业转化"的完整生态,强调计算结果的真实世界落地。2026年9月下旬,"长江杯"、清华PDC2026与镁伽Poreva Open三大蛋白质设计赛事在一周内相继启动;10月13日,思朗科技×镁伽科技宣布以Poreva Open为首个落地场景共建"科学算力×自主实验室"基础设施。
Yangtze Cup 2026 Global AI Protein Design Challenge · 纳米抗体/迷你结合蛋白从头设计 × 大规模湿实验验证
"长江杯"于2026年9月24日正式启动,是目前国内奖金额度最高、联合机构规模最大的AI蛋白质设计赛事。大赛在上海市经济和信息化委员会、上海市科学技术委员会指导下,由上海交通大学、上海人工智能实验室、临港实验室、昌平实验室、香港中文大学、浙江大学、上海科学智能研究院、未来启点社区共同发起主办,上海交通大学自然科学研究院承办;北京大学化学与分子工程学院、清华大学化学工程系、中国科学技术大学生命科学与医学部、复旦大学智能复杂体系实验室、西湖大学工学院、国家超级计算广州中心、上海仪电集团、科学智能战略科技力量联盟协办。
赛事以真实科学问题为牵引,将大规模湿实验验证引入竞赛核心环节:通过统一赛题、标准化实验和真实数据评价,让不同团队、不同模型、不同技术路线的设计在同一实验体系下接受检验,并为AI蛋白质设计Benchmark建设沉淀开放数据。
围绕赛事设置的多个蛋白质设计靶点,从头设计纳米抗体。VHH分子量约为常规抗体的十分之一,是药物与诊断领域应用价值最高的分子形态之一。
Nanobody / VHH · 多靶点从零生成自然界不存在的全新结合蛋白,代表当前AI从头设计蛋白质能力的前沿方向,考验生成模型与筛选策略的完整闭环。
Minibinder · De novo设计无需天然配体即可激活 NK2R 的纳米抗体 —— 结合不是终点,激活才是
PDC2026 是清华 FBS/FRCBS 平台继 2025 肽段设计竞赛后的新一届赛事,赛题难度显著升级:要求设计一个纳米抗体(nanobody),在无天然配体条件下独立激活 NK2R(神经激肽2受体,GPCR)。NK2R 具有独特的双重作用模式——中枢激活关联食欲控制,外周激活关联能量消耗提升——是代谢调控领域备受关注的药物靶点。本届竞赛的关键在于"功能性":仅与受体结合并不足够,设计必须推动受体构象进入激活态并产生可测量的激动剂活性(agonist activity)。
前一届 2025 Peptide Design Competition 已完成真实实验验证:最强参赛设计的 EC50 达 2 nM,超过天然肽配体 NKA,首次证明了 AI 设计分子走完"序列生成—结构预测—化学合成—功能测定"全链路的可行性。
每人提交 3 条相互独立的纳米抗体候选序列;全长 100–150 aa;框架区来源与序列不限;不限制结合位点与设计路线,不按作用机制加减分。
Nanobody · 3条独立设计组委会用 AlphaFold3 预测纳米抗体与 NK2R + Gα 激活态复合物结构:ipTM(纳米抗体–NK2R 界面)> 0.6 者入围,再按 ΔSASA 排序取前 300 名进入合成测试。
AF3 · ipTM>0.6 · ΔSASA Top300| 奖项 | 名额 | 奖金 |
|---|---|---|
| 金奖 | 1名 | ¥35,000(≈$5,000) |
| 银奖 | 2名 | ¥14,000/名(≈$2,000) |
| 铜奖 | 3名 | ¥7,000/名(≈$1,000) |
企业发起 · 万级设计统一双盲湿实验验证 · 科学算力×自主实验室共建 · 构建AI蛋白设计的"科学标尺"
2026年9月22日,苏州工业园区企业镁伽科技宣布发起 Poreva Open——全球AI蛋白质设计挑战赛,携手国内头部药企、明势创投等合作伙伴搭建产业创新平台(明势创投从早期科技投资到科技成果转化视角参与生态共建,连接创新团队与产业资源)。赛事以「Proof, not promises」为理念,依托真实药物研发需求设置赛题与评价维度,围绕分子设计结果和真实实验表现,对完整蛋白质设计系统在真实实验中的泛化能力、成功率和研发效率进行综合评估,目标是构建AI蛋白质设计的"科学标尺",推动设计成果落地转化。面向全球科研团队、人工智能团队、生物技术企业、高校实验室开放,不限定模型与技术路线;但仅接受团队报名(≥3 人,工作邮箱验证隶属机构),不接受个人与匿名参赛。10月13日,上海市国资委披露思朗科技与镁伽科技达成战略合作,思朗科技以联合发起方身份为参赛团队提供科学算力支持,双方共建覆盖「算力—数据—验证」全链条的 AI for Science 基础设施,Poreva Open 成为该合作的首个落地场景。
官网如期放出第一轮三道赛题,全部来自真实药物研发项目,每题约 2,000 条设计进入 Megalaxy Lab 自动化湿实验平台。值得第一时间指出:三题在靶点、任务结构与评价维度上与 Anthropic×Adaptyv(Proteinbase)五连挑战前三题高度同源——同样的 EGFR/TNF-α 条件化 binder 与 GLP1R 激动剂、同样的 pH 开关方向、同样的分子类别与 de novo 硬筛。两个赛事实质上构成一次跨生态镜像基准:同一套题面,分别在 Adaptyv(北美)与 Megalaxy Lab(中国)两条自动化实验线上跑,且不向中国居民/实体开放的 Anthropic 赛事所设门槛,在 Poreva Open 一侧不存在(面向全球团队)。题面逐条拆解如下。
靶点为人源 EGFR 胞外区与小鼠 EGFR 两个构建体。设计要求同一序列在五条目标上同时成立,官方给出的排名优先级为 pH 选择性 > 小鼠交叉反应 > 亲和力 > 低非特异 > 热稳定性:
靶点为人源与小鼠可溶性 TNF-α,两者均以三聚体形式供给(SEC-MALS 约 45–62 / 50–65 kDa),每个靶点呈递三个相同的受体结合表位;人/鼠可溶性域序列一致性 79%(156 个对齐残基中 124 个相同)。TNF-α 是类风湿关节炎与克罗恩病抗体药的既定靶点。五目标同 C1,但 pH 开关方向相反:
靶点升级为人源 GLP1R(七次跨膜 GPCR,2 型糖尿病与肥胖药物靶点),以 DDM/CHS 去垢剂中受体形式供给;题面列出残基 24–432(覆盖胞外域、七次跨膜螺旋与胞内段首部)的野生型 UniProt 片段,供应构建体带 N 端 FLAG 与 C 端 His 标签,并含供应商未公开的热稳定突变——页面序列与实测构建体在个别位点上可能有差异。本题为四目标,且不计 pH 与物种条件,核心是功能激活:
第二轮两题将于 11 月 8 日发布,提交窗口 11.9–12.8,遴选公告 12.16。结合首轮"条件化结合 → 功能激活"的出题轴心,二轮大概率继续加码功能性或多目标设计维度。
每题满分 200 分,指标权重按题公布;单项指标取该题前十名,按名次乘以 100%→23% 的递减系数(第 1 名 100%、第 2 名 85%、第 3 名 72%……第 10 名 23%)。总冠军按五题累计得分排名——只打一题很难上榜,赛制鼓励五题全打。首轮三题权重分布:
| 指标 | C1 EGFR | C2 TNF-α | C3 GLP1R |
|---|---|---|---|
| 受体激活(细胞功能) | — | — | 100 分 · 50% |
| pH 选择性结合 | 60 分 · 30%(pH6.5/7.4 亲和比) | 60 分 · 30%(pH7.4/6.0 亲和比) | — |
| 物种交叉反应(小鼠) | 50 分 · 25% | 50 分 · 25% | — |
| 结合亲和力(功能表位) | 40 分 · 20% | 40 分 · 20% | 50 分 · 25% |
| 低非特异结合 | 30 分 · 15% | 30 分 · 15% | 30 分 · 15% |
| 热稳定性 | 20 分 · 10% | 20 分 · 10% | 20 分 · 10% |
注意多个指标设有资格阈值:人源亲和力须先过线,其余指标才计入分——亲和力不达标时 pH 选择性、交叉反应、热稳定分一律作废,排序规则在筛掉"不结合的花架子"。
| 奖项 | 奖励 |
|---|---|
| 总榜前三名 | ¥1,000,000 / ¥500,000 / ¥200,000(现金) |
| 总榜前十 | ¥3M–20M 投资意向(须经尽调) |
| 五道赛题各自的单题冠军 | Megalaxy Lab 免费湿实验验证(验证量随赛事推进陆续公布) |
10月13日,联和投资公司投资企业思朗科技与镁伽科技宣布战略合作:思朗承建的科学算力基础设施与镁伽承建的实验基础设施已双双落地孝感算力生态链产业园,在同一园区实现物理合体——算力产生的每一个仿真结果"下楼就能接受实验的检验",构成一条端到端打通的药物发现"高速公路"。双方立足 Poreva Open 推进三项落地合作:
思朗科技作为 Poreva Open 联合发起方,为参赛团队提供科学算力资源支持,降低全球创新团队的参赛门槛。10.18 公布的 FAQ 已落地一项具体支持:可选的分子动力学(MD)设计评估——对候选分子做动态检查,看结构是否立得住、结合是否保得住;非必需,有意团队可致函 userservice@yangtze3d.com。
联合发起方依托思朗「天穹」3D 科学计算机对大赛产出的候选分子开展分子动力学深度研究——AI 给出设计、计算验证结构、实验验证生物,三重互证;研究数据遵循大赛数据开放政策。
MD 深度研究湿实验数据与仿真数据双向流动,共同反哺蛋白质设计科学模型的持续迭代,形成「干湿闭环」的数据飞轮。
数据飞轮以「统一赛题、统一实验体系、统一评价标准」让所有模型和设计路线在同一实验基准下横向比较,并在正式提交前公开及冻结核心规则,遵循四条原则:
赛题、实验协议、评分规则在设计提交前公开,减少规则变化对参赛结果的影响。
提交前公开参赛设计和实验执行环节进行信息隔离,降低人为因素对实验过程和结果判断的影响。
信息隔离在知识产权与合规要求允许的范围内,统一整理实验样本、结果及相关数据并逐步向社区开放——失败数据同样纳入体系,帮助研究者了解不同设计方法的边界。
含阴性结果镁伽科技及产业合作方相关团队将参与赛事并作为参考队伍独立排名,不占用参赛团队的奖项及合作机会。
不占奖项名额10.18 发布的评价体系给出六项官方验证维度:结合亲和力、热稳定性、物种交叉反应(临床前物种直系同源靶点结合)、特异性结合(对非目标蛋白无可检测结合)、pH 选择性结合、细胞功能(激活/阻断等功能活性)。在基础实验验证之外,排名领先的设计将进入更复杂的生物学验证体系,在类器官等更接近真实生理环境的模型中接受进一步评价——比赛关注的不只是能否实现预期结合,还包括在更真实生命体系中的功能表现与作为潜在药物候选物的开发价值。首轮三题的指标组合已经坐实主线:条件化与功能性优先于静态亲和力。
Shanghai International Computational Biology Innovation Challenge
2026上海国际计算生物学创新大赛(SICBC)于6月25日在浦东正式发布并全面启动,这是大赛连续第三年举办。赛事紧扣上海计算生物学创新发展布局,建立"AI设计—实验验证—反馈优化"的闭环机制,不只关注模型在历史数据集上的表现,更强调计算结果能否真正进入湿实验验证。面向全球科研团队、企业研发团队、高校师生及创新主体开放招募,决赛将于2026年12月举行。
靶点为HSV DNA聚合酶(HSV Pol),要求利用AI与计算生物学方法筛选非核苷类小分子抑制剂,需同时抑制野生型及三种耐药突变体(W781V、N815S、Y941H)。指定化合物库约1000万分子,每队提交100个排序分子。
HSV Pol · 抗病毒靶点为PVRIG(CD112R)免疫检查点,目标是设计高亲和力、高特异性抗体分子阻断PVRIG与PVRL2结合,解除肿瘤免疫抑制。接受IgG单抗和VHH纳米抗体,CDR与已知阳性参考抗体序列相似度须低于80%。
PVRIG · 肿瘤免疫| 奖项 | 名额 | 奖金(税前) |
|---|---|---|
| 一等奖 | 1队 | ¥100,000 |
| 二等奖 | 2队 | ¥30,000/队 |
| 三等奖 | 2队 | ¥20,000/队 |
| 优胜奖 | 5队 | ¥10,000/队 |
北京前沿生物结构研究中心 · 国际结构生物学会议、工作坊与竞赛
FBS(Frontiers in Biological Structures)是由北京前沿生物结构研究中心(FRCBS)组织的国际学术会议、工作坊、讲座与竞赛系列。FRCBS成立于2018年,依托清华大学开展结构生物学研究,重点覆盖生物大分子机器、疾病相关膜蛋白、肿瘤抑制因子、冷冻电镜技术、AI驱动的新型生物结构技术,以及基于结构的药物发现与开发。
FBS官网将会议与竞赛作为同一学术平台运营,为中国的AI4Science赛事生态补充了结构生物学和蛋白/肽段设计方向的国际组织方。官网公开信息显示,FBS活动已覆盖生物、化学、物理、神经科学及其交叉领域,并在清华大学举办。
FBS 平台 2026 赛季已上线:Protein Design Competition 2026 要求设计无天然配体即可激活 NK2R 的纳米抗体激动剂,提交窗口 2026.09.24–11.11,详见本页上方 PDC2026 卡片。
FBS官网设有Peptide Design Competition页面,公开结果表包含候选肽序列、设计方法和多项评分,适合比较扩散模型、进化算法及自定义集成方法在肽段设计任务中的表现。
肽段设计 · 结构生物学赛事结果页面同时提供与合成筛选相关的公开结果资源,使计算候选物、排序指标和后续实验验证之间形成可追踪的连接。
候选排序 · 实验验证World Science AI Competition · AI4S智能体CNS挑战赛
第四届世界科学智能大赛首创AI4S智能体CNS挑战赛,将竞技对象从科学领域算法模型拓展至自主科研智能体(Autonomous Research Agent)。参赛智能体需在零人工干预条件下,独立完成文献理解、代码重构、假设提出、实验验证与结果迭代,并挑战CNS等顶级期刊已发表成果的当前最优水平(SOTA)。大赛同时设有四大算法赛道,独家开放实测数据集与高精度仿真系统。
四大任务:DrugClip高通量虚拟筛选优化、靶向分子设计与逆合成规划闭环、蛋白质构象系综生成、神经算子自动改进。要求智能体零人工干预完成科研全生命周期闭环。
自主科研Agent依托新奥玄龙-50U球形环装置高精度仿真环境,聚焦托卡马克聚变装置位形控制。采用强化学习在线实时交互训练模式,晋级队伍可进入实体装置实验室上机实测。
强化学习 · 在线交互接入内蒙古电力交易中心一手实测数据,直击新能源并网波动大、负荷预判难等痛点,以行业刚需驱动技术创新。
实测数据 · 产业一线瞄准RNA–蛋白复合物三维结构预测的瓶颈,引导选手融合AI技术搭建智能建模框架,突破现有结构预测方法的局限。
RNA-蛋白 · 结构预测开放复旦大学出土文献与古文字研究中心独家整理的权威数据集,要求破解复杂背景、风化噪声、字符粘连等难点。
独家数据 · 文字识别4th AI Drug-Development Competition · 按研发阶段设计 Agentic AI
第4届 JUMP AI 将竞赛重心从单点模型迁移到agentic AI:参赛者需针对药物研发全流程中的真实痛点,设计能自主设定目标、调用工具并闭环迭代的智能体方案。参赛资格面向大韩民国境内个人或不超过3人团队。AnySearch 检索到 KHIDI 官方通报与相关报道(2026-06-29/30)。
围绕靶点/机制/适应症提出可检验假设,并构建文献—数据—实验规划闭环。
Hypothesis Agent对接对接、生成模型、ADMET 等工具,形成“设计—评分—再设计”的分子优化 Agent 循环。
Molecule Optimization Loop面向 IND/临床方案、法规材料与试验设计智能化,强调可审计与合规输出。
Regulatory · Clinical Design跨多个研发阶段整合 Agent 能力,强调工程可部署性与产业对接价值。
Integration| 奖项 | 奖励 |
|---|---|
| 大奖 / 保健福祉部长官奖 | ₩10,000,000 |
| 优秀奖 / KHIDI 院长奖 | ₩5,000,000 |
| 优胜奖(协会长/医学院院长等) | ₩3,000,000 |
| 鼓励奖 | ₩2,000,000 |
| 赞助奖 | ₩1,500,000 |
美国与国际AI4Science赛事以盲测挑战(Blind Challenge)为核心范式,强调模型在未见数据上的泛化能力与实验验证的严格性。
五连挑战 · 5,000+ 设计进入自动化湿实验验证 · 全量数据 ODC-BY 开放
迄今规模最大的公开蛋白设计验证赛事:不设现金奖,筹码是算力与湿实验——入选设计全部进入 Adaptyv 自动化实验室合成表征,序列、结构、方法、实验数据(含阴性结果)以 ODC-BY 许可公开于 Proteinbase。遴选由 Anthropic 与 Adaptyv 预写的 Claude 工作流执行(提示词不公开,防指标过拟合),方法新颖性计入遴选维度;提交材料中的 prompt injection 可直接判出局。
学术队最高 $50k、产业队 $25k Claude 额度;约 30 队;每题预留 ~15 个测试名额。申请已截止。
每题提交 20–40 个设计需机构隶属;获 Claude Max 20x 赛期使用权;测试名额不保证。申请已截止。
每题至多 20 个设计自备工具与算力、Claude 可选;经同一遴选流程考虑测试。当前唯一仍开放提交的入口——但受下方 Section 3.1 资格条款约束。
注册 Proteinbase 即可提交首页写着「Open to everyone and free to enter」,但官方条款 Section 3.1对全部三轨统一设限:参赛者不得为 Belarus、China、Cuba、Iran、Myanmar、North Korea、Russia、Sudan、Syria、Crimea 及所谓 DPR/LPR 等司法辖区的合法居民或注册实体,且不得为美国及其他适用出口管制、制裁或类似法律禁止的对象。换言之,中国居民与中国注册实体按条款不可正式参赛,开放轨也不例外——对本站读者,该赛事的合理姿势是跟踪题面方法学、遴选机制与次年 1 月的 ODC-BY 开放数据,而非提交设计。
设计针对人源 EGFR 胞外区(建议 domain III 功能表位,PDB 6ARU——西妥昔/帕尼单抗同表位)的 binder,三目标须同时成立,且排名优先级为 pH 选择性 > 小鼠交叉反应 > 亲和力——官方明确"弱但明确 pH 敏感的 binder 可能比高亲和力但不敏感者更具影响力",本质是鼓励攻克条件化开关而非刷亲和力:
设计针对可溶性 TNF-α 三聚体(PDB 1TNF;三个受体结合位点位于亚基界面,即阿达木单抗/英夫利昔单抗的中和表位)的 binder。人/鼠可溶性域 79% 同源,两构建体均以三聚体形式供测(SEC-MALS 约 45–62 / 50–65 kDa),每个靶点呈递三拷贝表位。同样三目标,但 pH 开关方向与 C1 相反:
前两题用可溶性靶点考"条件化结合",C3 升级为膜受体的功能激活:人源 GLP1R(七次跨膜 GPCR,司美格鲁肽/替尔泊肽的靶点)以 DDM/CHS 去垢剂中受体形式供给(PDB 6X18,残基 24–432 覆盖胞外域 + 7TM + 胞内段首部;供应构建体带 FLAG/His 标签及未公开的热稳定突变)。两目标、不设物种与 pH 条件:
排序维度:亲和力 → 功能激活确认。这是出题轴心的第二次加码:从"在对的 pH 结合"升级为"让受体真正工作"。
评奖按五类分子分层:minibinder(40–100 aa)、大蛋白(>100 aa)、microbinder(<40 aa)、纳米抗体、抗体(scFv/Fab);各题按类别分别评奖。
每题约 1,500 个设计进湿实验(Track 1 50%、Track 2/3 各 ~25% 即 ~375 个)。Track 1 通过硬筛后取 CSV 前 20 个(排序方法直接决定被测对象);Track 2/3 的全部合格设计与所附信息打包给 Claude,由 Anthropic 与 Adaptyv 预写的选择提示词按"预测质量 + 设计新颖性 + 方法新颖性"挑选——选择 prompt 刻意不公开,防止围绕单一指标过度优化;在提交材料中嵌入指令或 prompt injection 可直接判取消资格。这是公开赛事中少见的 LLM-as-judge 选样设计:方法文档的严谨度本身就是竞争力。
17th Community Wide Experiment on the Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction
CASP是蛋白质结构预测领域最权威的盲测评估实验,自1994年起每两年举办一届。CASP16(2024)结果显示深度学习方法在某些关键领域出现性能平台期。CASP17的核心目标是催化深度学习尚未突破、且具有重大实际应用意义的领域的进展。规则简述:"如果AlphaFold3能生成高质量模型,那它就不是CASP级别的挑战;如果AF3也束手无策,那就是我们需要的。"
当前深度学习方法的重大失败领域。需要抗体-抗原、纳米抗体-抗原、T细胞受体复合物等非同源靶标集。
抗体-抗原 · TCR对小分子药物开发具有显著重要性。CASP16显示深度学习方法常未达实验精度。需要3D蛋白-配体复合物和亲和力排序数据。
药物设计 · 配体结合尽管声称已解决,CASP16和Kaggle挑战显示深度学习方法在缺乏同源结构信息时表现不佳。需要非同源RNA/DNA结构和蛋白-核酸复合物。
RNA/DNA · 蛋白-核酸CASP的重大扩展领域。测试从离散构象到半无序态的结构系综计算方法。需要多构象高分辨率靶标和低温电子断层、SAXS、NMR等多分辨率数据。
构象系综 · 动态结构膜蛋白、弱进化信息蛋白(病毒/寄生虫来源)、大分子复合物(>1000氨基酸)等当前深度学习方法的临界弱点。
膜蛋白 · 弱同源Critical Assessment of PRedicted Interactions · Protein Assembly Blind Challenge
CAPRI 是蛋白质/大分子复合物对接与组装预测的权威盲测实验。Round 65 为第7届联合 CASP-CAPRI Assembly Prediction challenge,与 CASP17 同步:Server 与 Human predictor 均可提交,并在可能时提供 Scoring 挑战。官方页明确 CASP17 季自 4 月 27 日开启并持续至 2026 年 8 月。
Critical Assessment of Computational Hit-finding Experiments
CACHE 是面向计算化学/AI 药物发现的前瞻性 hit-finding 盲测:参赛者预测与疾病相关蛋白结合的小分子,由 CACHE 统一采购并做实验验证;命中发现轮后还有命中扩展轮。所有化学结构与实验数据公开、无使用限制。#8 聚焦 GID4 底物结合口袋(参考结构 6CCT 与 7SLZ),目标是发现可用于劫持 CTLH E3、推进靶向蛋白降解策略的新颖化学型。
De Novo Protein Binder Design Against RBX-1 E3 Ubiquitin Ligase
GEM×Adaptyv RBX-1 Binder Design Competition 2026汇集计算蛋白质设计社区,挑战一个生物学意义重大但设计难度极高的靶标。参赛者提交从头设计(de novo)的蛋白binder序列,Adaptyv将300个设计在湿实验室合成并测试表达和结合亲和力。结果在ICLR 2026 GEM Workshop公布,所有参与者获得全部测试设计的实验数据和开源数据集。
RBX-1(RING Box Protein 1 / ROC1)是108个氨基酸的E3泛素连接酶组分,对SCF(SKP1-CUL1-F-box)复合物至关重要。参与细胞周期调控、信号转导和癌症生物学,在多种人类癌症中过表达。设计挑战在于:N端(1-39位)内在无序,C端RING-H2结构域由三个锌离子交叉支撑——柔性与刚性金属配位的组合测试当前设计方法的极限。
| 奖项 | 奖金 | 其他 |
|---|---|---|
| Best Designed Binder | $1,000 USD | 3D打印蛋白结构模型 |
| Runner-up | $100 USD | 3D打印蛋白结构模型 |
| 所有参与者 | — | 实验数据 + 开源数据集 + 社区论文署名 |
Pregnane X Receptor Activation Prediction · Activity & Structure Dual Track
OpenADMET PXR Blind Challenge是AI药物发现领域最严格的盲测基准之一。PXR(孕烷X受体)是一种外源化合物传感器,可触发药物代谢。PXR诱导是药物发现中常见的liability,通常在后期先导优化中才被发现。该挑战赛发布了迄今最大、最一致的PXR诱导数据集——超过11,000个化合物的数据(来自Octant低成本高保真体外实验),包括4,000+化合物的完整剂量-响应数据。
传统表格数据预测任务,预测pEC50值。分两阶段:Phase 1有实时排行榜(Analog Set 1),Phase 2无实时排行榜(Analog Set 2盲测)。评估指标:MAE(越低越好)、Spearman ρ、RAE。
pEC50 · ADMET预测配体在高度柔性的PXR结合口袋中的三维结构。评估指标:LDDT-PLI(越高越好)、BiSyRMSD(CASP15开发的对称校正配体RMSD)。184个小分子的X射线晶体结构作为评估基准。
3D结构 · 配体结合Polaris Hub · Potency / ADMET / Ligand Poses 三子赛
ASAP(NIH 资助的开源抗病毒联盟)在披露临床前候选前,与 OpenADMET、Polaris 共同发起面向真实药物发现数据的社区盲测,是 2026 OpenADMET PXR Challenge 的前序基准。
由 SARS-CoV-2 Mpro 结构迁移预测 MERS-CoV Mpro 配体姿态;评估 <2Å 成功率与 RMSD。
Pose · Cross-virus预测双病毒 Mpro 活性,强调真实多终点决策而非单指标刷榜。
Potency · MproMLM/HLM、KSOL、LogD、MDR1-MDCKII 等 5 终点(训练 434 / 测试 126)。
ADMET · 5 endpoints为 AI Scientist(K Pro)构建 MCP 工具与 Agentic 组件
两日黑客松:前沿 AI 如何在复杂生物数据上推理与行动。参赛者围绕 Owkin AI Scientist K Pro 开发 MCP 工具与多智能体工作流;可访问 MOSAIC Window、TCGA 与 API credits。申请截止约 2026-06-30。
DYRK1B Virtual Screening Challenge · Olomouc 2026
第9届高级药物设计工作坊(9ADD)的竞赛环节,聚焦DYRK1B(双特异性酪氨酸磷酸化调控激酶1B)的虚拟筛选。DYRK1B在肿瘤学和非酒精性脂肪肝中是关键治疗靶点。参赛者从3,365个化合物的盲测库中选出100个最可能具有活性的DYRK1B抑制剂,排行榜以recall(召回率)排序。最佳预测将获得奖品并考虑进行化合物购买和实验验证。
| 方法 | Recall | 说明 |
|---|---|---|
| LGBM+CHEESE consensus | 0.67 | 最佳:梯度提升+CHEESE嵌入共识 |
| CHEESE ShapeSim (mean-cos) | 0.53 | 形状相似性基线 |
| CHEESE ESPSim (mean-cos) | 0.40 | 静电势相似性基线 |
| Ensemble (ESP+Shape, mean-rank) | 0.47 | 集成排序 |
| Morgan Fingerprint (Tanimoto) | 0.07 | 传统分子指纹基线 |
Gemma Life Sciences Challenge · AI for Drug Discovery & Precision Oncology
Kaggle Gemma 4 Good Hackathon 2026的Gemma Life Sciences赛道,要求参赛者基于Google Gemma系列开源模型构建AI药物发现与精准肿瘤学应用。参赛项目涵盖从头药物分子生成、精准肿瘤学决策支持、药物-靶标文献智能检索等方向。该赛事的独特价值在于推动开源LLM在生命科学中的应用,所有模型可在Kaggle T4 GPU(16GB)上运行。
基于Gemma 4 E2B的LoRA微调模型,在225K药物-靶标对上训练,生成药物样SMILES分子。SMILES有效率从0%提升至100%,平均QED达0.591。训练数据来源:BindingDB、ChEMBL、MOSES。
分子生成 · LoRA6阶段精准肿瘤学Agent流水线:MedGemma提取靶标基因→ChEMBL知识图谱检索→RDKit+XGBoost分子评估→TxGemma毒性预测→安全验证→临床报告生成。支持35+癌型、50+关键基因靶标,10分钟内生成可操作报告。
精准肿瘤学 · Agent从活检到个性化淋巴瘤治疗方案设计——mRNA疫苗肽段、设计抗体binder、CAR-T构建体。整合AlphaFold/IgFold + RFdiffusion + ProteinMPNN + OAS安全筛查,2小时内完成全流程,患者数据不离开本地。
个性化治疗 · RFdiffusion本地部署的临床研究助手,使用Gemma 4(通过Ollama)搜索生物医学文献并合成带引用的摘要。查询和响应均不离开研究者机器。多源检索:Europe PMC、PubMed、ClinicalTrials.gov。
文献检索 · IP-safeDrug Discovery Chemistry 2026 · AI/ML Part 2
Drug Discovery Chemistry 2026的AI/ML分会场聚焦AI在药物发现中的深度应用,涵盖配体-受体对接与虚拟筛选、联邦学习、基因组学与遗传学、ADMET预测、生成式分子设计等方向。不同于学术竞赛的闭环验证模式,该会议更侧重产业落地与技术合作对接。
Science / AAAS 多轮计算设计验证竞赛
由Science/AAAS组织的肽段设计挑战赛,采用多轮迭代验证模式:第一轮中候选肽段进行活性测试,第二轮基于第一轮结果进行优化并测试选择性。赛事核心价值在于揭示计算预测与实验结果之间的对齐程度——即"预测-实验"差距,为AI蛋白质/肽段设计方法的实验验证提供了标准化基准。
从模型创新到大规模资本投入与产业突破
Observed Antibody Space
Patent & Literature Antibody DB
Integrated Nanobody Database
RCSB Protein Data Bank
SICBC指定1000万分子库
PVRIG: Q6DKI7 / PVRL2: Q92692
开源化学信息学工具包
从头蛋白质/binder设计
蛋白-配体复合物结构预测
药物-靶标结合活性数据库
分子静电势/形状相似性嵌入
蛋白质序列逆折叠设计
Google开源生命科学LLM
高通量蛋白质湿实验验证平台
开放ADMET预测基准与数据集
药物发现盲测与基准平台
计算 hit-finding 实验验证闭环
复合物对接与组装盲测
GEM×Adaptyv 开放实验数据