2026 AI4Science Competitions Hub · 更新 10.18

AI4Science 赛事汇总
从计算生物学到自主科研智能体

2026年,全球AI4Science赛事进入新阶段:从模型算法竞赛升级为"AI设计—实验验证—反馈优化"的闭环实战。9月下旬中国蛋白质设计赛事三连发——上交大自然科学研究院承办的"长江杯"2026(百万奖池、≥5000条设计免费湿实验)、清华FBS PDC2026(NK2R纳米抗体激动剂)、镁伽科技Poreva Open(万级双盲湿实验基准)相继开闸;10月13日思朗科技宣布以联合发起方身份加盟,科学算力×自主实验室共建;10月18日首轮三题如期发布——条件化 EGFR binder、条件化 TNF-α binder、GLP1R 激动剂,与 Anthropic×Adaptyv 五连挑战前三题高度同源,构成跨生态镜像基准。本页系统汇总中国(长江杯、PDC2026、Poreva Open、SICBC、清华FBS/FRCBS、WSAI)、韩国(第4届 JUMP AI 智能体新药竞赛)与美国/国际(CASP17、CAPRI Round 65、CACHE #8、GEM×Adaptyv、OpenADMET/Polaris、Owkin Rewiring Biology 等)重大赛事的赛道、赛制、奖金与时间节点。

18+
重大赛事
30+
竞赛赛道
2万+
全球参赛者
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赛事导航 · Competition Index

🇨🇳 中国赛事

以上海为核心,中国AI4Science赛事已形成"算法竞赛+实验验证+产业转化"的完整生态,强调计算结果的真实世界落地。2026年9月下旬,"长江杯"、清华PDC2026与镁伽Poreva Open三大蛋白质设计赛事在一周内相继启动;10月13日,思朗科技×镁伽科技宣布以Poreva Open为首个落地场景共建"科学算力×自主实验室"基础设施。

长江杯 · 首届 · 🇨🇳 · 报名中

"长江杯" 2026全球AI蛋白质设计挑战赛

Yangtze Cup 2026 Global AI Protein Design Challenge · 纳米抗体/迷你结合蛋白从头设计 × 大规模湿实验验证

承办:上海交通大学自然科学研究院 奖金池:¥1,000,000 报名:2026.09.24 — 10.31

赛事概览

"长江杯"于2026年9月24日正式启动,是目前国内奖金额度最高、联合机构规模最大的AI蛋白质设计赛事。大赛在上海市经济和信息化委员会、上海市科学技术委员会指导下,由上海交通大学、上海人工智能实验室、临港实验室、昌平实验室、香港中文大学、浙江大学、上海科学智能研究院、未来启点社区共同发起主办,上海交通大学自然科学研究院承办;北京大学化学与分子工程学院、清华大学化学工程系、中国科学技术大学生命科学与医学部、复旦大学智能复杂体系实验室、西湖大学工学院、国家超级计算广州中心、上海仪电集团、科学智能战略科技力量联盟协办。

赛事以真实科学问题为牵引,将大规模湿实验验证引入竞赛核心环节:通过统一赛题、标准化实验和真实数据评价,让不同团队、不同模型、不同技术路线的设计在同一实验体系下接受检验,并为AI蛋白质设计Benchmark建设沉淀开放数据。

赛题方向

🧬

纳米抗体(VHH)从头设计

围绕赛事设置的多个蛋白质设计靶点,从头设计纳米抗体。VHH分子量约为常规抗体的十分之一,是药物与诊断领域应用价值最高的分子形态之一。

Nanobody / VHH · 多靶点
🧩

迷你结合蛋白(Minibinder)从头设计

从零生成自然界不存在的全新结合蛋白,代表当前AI从头设计蛋白质能力的前沿方向,考验生成模型与筛选策略的完整闭环。

Minibinder · De novo

赛制时间线

2026.09.24 — 10.31
报名通道开启,面向全球高校、科研院所、企业研发团队、跨学科创新团队及独立研究者开放
报名后 — 评审阶段
统一标准化流程筛选候选设计,不少于5000条设计序列进入免费湿实验检测
湿实验验证
覆盖表达、纯化、检测步骤,以真实实验结果作为评价设计性能与产生优胜团队的核心依据

赛事亮点

  • 奖金总额100万元人民币,面向全球开放且不限定模型与技术路线
  • 不低于5000条设计序列免费湿实验验证——国内首个把"万级/千级统一湿实验"作为赛事核心环节的蛋白设计竞赛
  • 十余家顶尖机构联合发起:高校、国家实验室、上海AI基础设施与未来启点社区共同背书
  • 沉淀真实实验数据与评价体系,目标形成持续迭代的开放Benchmark
  • 探索跨机构、跨学科、跨领域协同攻关的新型科研组织方式

关键信息

承办单位
上交大自然科学研究院(INS)
湿实验规模
≥5,000 条设计序列
设计对象
VHH / Minibinder
联系邮箱
zbztzhz@sjtu.edu.cn
查看大赛官方公告(INS SJTU)
PDC2026 · 清华 FBS · 🇨🇳 · 提交开放中

Protein Design Competition 2026:NK2R 纳米抗体激动剂设计

设计无需天然配体即可激活 NK2R 的纳米抗体 —— 结合不是终点,激活才是

主办方:北京前沿生物结构研究中心(FRCBS)· 清华大学 提交截止:2026.11.11 24:00 (UTC+8) 结果公布:2027.04

赛事概览

PDC2026 是清华 FBS/FRCBS 平台继 2025 肽段设计竞赛后的新一届赛事,赛题难度显著升级:要求设计一个纳米抗体(nanobody),在无天然配体条件下独立激活 NK2R(神经激肽2受体,GPCR)。NK2R 具有独特的双重作用模式——中枢激活关联食欲控制,外周激活关联能量消耗提升——是代谢调控领域备受关注的药物靶点。本届竞赛的关键在于"功能性":仅与受体结合并不足够,设计必须推动受体构象进入激活态并产生可测量的激动剂活性(agonist activity)。

前一届 2025 Peptide Design Competition 已完成真实实验验证:最强参赛设计的 EC50 达 2 nM,超过天然肽配体 NKA,首次证明了 AI 设计分子走完"序列生成—结构预测—化学合成—功能测定"全链路的可行性。

提交规则

🧬

序列要求

每人提交 3 条相互独立的纳米抗体候选序列;全长 100–150 aa;框架区来源与序列不限;不限制结合位点与设计路线,不按作用机制加减分。

Nanobody · 3条独立设计
🖥️

计算初筛

组委会用 AlphaFold3 预测纳米抗体与 NK2R + Gα 激活态复合物结构:ipTM(纳米抗体–NK2R 界面)> 0.6 者入围,再按 ΔSASA 排序取前 300 名进入合成测试。

AF3 · ipTM>0.6 · ΔSASA Top300

赛制时间线

2026.09.24 — 11.11 24:00 (UTC+8)
注册与序列提交;截止后不可替换或补充序列,无第二轮优化
2026.11.11 — 2027.03.31
合成与实验测试阶段;入围序列进行活性测定,最终排名由实验结果决定
2027.04
最终结果公布与颁奖典礼

奖金设置

奖项名额奖金
金奖1名¥35,000(≈$5,000)
银奖2名¥14,000/名(≈$2,000)
铜奖3名¥7,000/名(≈$1,000)

注意事项

  • 鼓励组队:3人及以上团队若全部序列未入选,可提名 1 条序列进入合成与测试阶段
  • 所有提交的序列与数据将开放共享,可被他人免费使用——参赛即视为同意开放条款
  • 组委会:Yafei Yuan、Xiangyu Liu、Boxue Tian、Jianzhu Ma(马剑竹);科学顾问委员会:施一公、王宏伟、王新泉、李海涛
  • 官方 WeChat(FRCBS-THU)可加入竞赛讨论群
访问 PDC2026 官方页面
Poreva Open · 镁伽×思朗 · 🇨🇳 · 首轮三题已发布 · 提交 10.19–11.18

Poreva Open 全球AI蛋白质设计挑战赛

企业发起 · 万级设计统一双盲湿实验验证 · 科学算力×自主实验室共建 · 构建AI蛋白设计的"科学标尺"

发起方:苏州镁伽科技有限公司(MegaRobo)× 思朗科技(联合发起方 · 科学算力) 首轮赛题(10.18 已发布):条件化 EGFR binder / 条件化 TNF-α binder / GLP1R 激动剂;二轮 C4–C5 题面 11.8 公布 验证规模:每题约 2,000 条设计进 Megalaxy Lab 湿实验(五题合计万级 · 规则赛前冻结 · 全程双盲 · 数据开放) 参赛资格:仅团队(≥3 人、工作邮箱验证隶属机构),面向全球,不限模型与技术路线

赛事概览

2026年9月22日,苏州工业园区企业镁伽科技宣布发起 Poreva Open——全球AI蛋白质设计挑战赛,携手国内头部药企、明势创投等合作伙伴搭建产业创新平台(明势创投从早期科技投资到科技成果转化视角参与生态共建,连接创新团队与产业资源)。赛事以「Proof, not promises」为理念,依托真实药物研发需求设置赛题与评价维度,围绕分子设计结果和真实实验表现,对完整蛋白质设计系统在真实实验中的泛化能力、成功率和研发效率进行综合评估,目标是构建AI蛋白质设计的"科学标尺",推动设计成果落地转化。面向全球科研团队、人工智能团队、生物技术企业、高校实验室开放,不限定模型与技术路线;但仅接受团队报名(≥3 人,工作邮箱验证隶属机构),不接受个人与匿名参赛。10月13日,上海市国资委披露思朗科技与镁伽科技达成战略合作,思朗科技以联合发起方身份为参赛团队提供科学算力支持,双方共建覆盖「算力—数据—验证」全链条的 AI for Science 基础设施,Poreva Open 成为该合作的首个落地场景。

首轮赛题全解析(10.18 已发布,提交窗口 10.19–11.18)

官网如期放出第一轮三道赛题,全部来自真实药物研发项目,每题约 2,000 条设计进入 Megalaxy Lab 自动化湿实验平台。值得第一时间指出:三题在靶点、任务结构与评价维度上与 Anthropic×Adaptyv(Proteinbase)五连挑战前三题高度同源——同样的 EGFR/TNF-α 条件化 binder 与 GLP1R 激动剂、同样的 pH 开关方向、同样的分子类别与 de novo 硬筛。两个赛事实质上构成一次跨生态镜像基准:同一套题面,分别在 Adaptyv(北美)与 Megalaxy Lab(中国)两条自动化实验线上跑,且不向中国居民/实体开放的 Anthropic 赛事所设门槛,在 Poreva Open 一侧不存在(面向全球团队)。题面逐条拆解如下。

C1 · 条件化 EGFR binder(题面页标 Open;首页卡片标"已关闭",两入口状态不一致)

靶点为人源 EGFR 胞外区与小鼠 EGFR 两个构建体。设计要求同一序列在五条目标上同时成立,官方给出的排名优先级为 pH 选择性 > 小鼠交叉反应 > 亲和力 > 低非特异 > 热稳定性:

  • 结合人源 EGFR,建议打 domain III 等功能表位(西妥昔单抗/帕尼单抗所在表位区域)
  • pH 6.5 结合 / pH 7.4 无可检测结合——6.5 模拟肿瘤微环境,让结合局限在肿瘤组织,对应组氨酸类 pH 感应元件设计
  • 同一序列兼结合小鼠 EGFR——临床前鼠模型可直接评价同一分子,省去单独开发鼠源 binder
  • 高特异性:与无关蛋白无可检测交叉反应(多特异性会带来血清清除快、组织滞留与脱靶毒性)
  • 高热稳定性:耐受制剂、运输与生产中的温度波动

C2 · 条件化 TNF-α binder(Open)

靶点为人源与小鼠可溶性 TNF-α,两者均以三聚体形式供给(SEC-MALS 约 45–62 / 50–65 kDa),每个靶点呈递三个相同的受体结合表位;人/鼠可溶性域序列一致性 79%(156 个对齐残基中 124 个相同)。TNF-α 是类风湿关节炎与克罗恩病抗体药的既定靶点。五目标同 C1,但 pH 开关方向相反:

  • pH 7.4 结合 / pH 6.0 无可检测结合——7.4 模拟血浆,6.0 模拟酸化早期内体;binder 在内体中放开抗原,抗原被清除而 binder 回收再用,是延长药效的成熟抗体工程策略
  • 其余四项目标与排序同 C1:小鼠交叉 → 亲和力 → 低非特异 → 热稳定

C3 · GLP1R 激动剂(Open)

靶点升级为人源 GLP1R(七次跨膜 GPCR,2 型糖尿病与肥胖药物靶点),以 DDM/CHS 去垢剂中受体形式供给;题面列出残基 24–432(覆盖胞外域、七次跨膜螺旋与胞内段首部)的野生型 UniProt 片段,供应构建体带 N 端 FLAG 与 C 端 His 标签,并含供应商未公开的热稳定突变——页面序列与实测构建体在个别位点上可能有差异。本题为四目标,且不计 pH 与物种条件,核心是功能激活:

  • 受体激活(细胞实验)——权重 50%:设计必须作为激动剂真正激活人源 GLP1R,只结合不激活不满足题意
  • 结合亲和力(建议功能表位)——25%
  • 低非特异结合——15%;热稳定性——10%

C4 / C5(二轮赛题,题面待公布)

第二轮两题将于 11 月 8 日发布,提交窗口 11.9–12.8,遴选公告 12.16。结合首轮"条件化结合 → 功能激活"的出题轴心,二轮大概率继续加码功能性或多目标设计维度。

计分机制:单题 200 分 × 名次系数

每题满分 200 分,指标权重按题公布;单项指标取该题前十名,按名次乘以 100%→23% 的递减系数(第 1 名 100%、第 2 名 85%、第 3 名 72%……第 10 名 23%)。总冠军按五题累计得分排名——只打一题很难上榜,赛制鼓励五题全打。首轮三题权重分布:

指标C1 EGFRC2 TNF-αC3 GLP1R
受体激活(细胞功能)——100 分 · 50%
pH 选择性结合60 分 · 30%(pH6.5/7.4 亲和比)60 分 · 30%(pH7.4/6.0 亲和比)—
物种交叉反应(小鼠)50 分 · 25%50 分 · 25%—
结合亲和力(功能表位)40 分 · 20%40 分 · 20%50 分 · 25%
低非特异结合30 分 · 15%30 分 · 15%30 分 · 15%
热稳定性20 分 · 10%20 分 · 10%20 分 · 10%

注意多个指标设有资格阈值:人源亲和力须先过线,其余指标才计入分——亲和力不达标时 pH 选择性、交叉反应、热稳定分一律作废,排序规则在筛掉"不结合的花架子"。

奖项:现金 + 投资意向 + 免费湿实验验证

奖项奖励
总榜前三名¥1,000,000 / ¥500,000 / ¥200,000(现金)
总榜前十¥3M–20M 投资意向(须经尽调)
五道赛题各自的单题冠军Megalaxy Lab 免费湿实验验证(验证量随赛事推进陆续公布)

提交规范与硬性筛选

  • 数量与排序:每队每题提交 24 条序列,CSV 按团队优先级自上而下排列(第 1 行最想被验证);每题约 2,000 条进湿实验,按提交顺序验证、容量有限先到先得——晚提交可能不进本轮验证,宜早交
  • 分子类别:de novo 单链蛋白(>40 且 ≤250 aa)/ 纳米抗体(ANARCI 类工具注释为准,建议从常见框架出发)/ scFv(须用 G4S 连接肽)/ 成对 VH/VL(仅交 FR+CDR,验证时融合人源 IgG1 恒定区 + κ 轻链;VH/VL 占每题验证量上限 20%)
  • 表达系统:无细胞表达(C 端 His)或哺乳细胞 HEK293(C 端 Fc);VH/VL 只能哺乳表达;无需自行加标签,由 Megalaxy Lab 按类别与系统统一添加
  • de novo 硬筛:不得以任何既有 binder 为起点或支架,须与已知蛋白保持足够序列/结构多样性(抗体看 CDR 多样性);官方可做相似度检查,违规设计取消验证与计分,严重者取消团队资格
  • 随附信息:CSV 之外须填报分子类别、使用的 AI 模型与期望表达系统;鼓励附预测指标(ipTM、ipSAE、自洽性、物理指标、可开发性评分)、结构文件与方法学说明——遴选评审会参考,材料越完整越有利;提交材料中嵌入指令或 prompt injection 直接判出局(与 Proteinbase 条款同源)
  • 成本与工具:参赛免费,官方不提供也不补贴设计算力、不偏向任何模型;思朗科技提供可选的分子动力学(MD)辅助评估(动态检查结构是否立得住、结合是否保得住,非必需,联系 userservice@yangtze3d.com)
  • 知识产权与数据:设计所有权归团队;官方仅用于验证与发布,部分入选序列与测量数据将按官方竞赛条款的开放数据许可在平台公布;团队可拿回自己设计的全部检测数据

思朗科技加盟:科学算力 × 自主实验室

10月13日,联和投资公司投资企业思朗科技与镁伽科技宣布战略合作:思朗承建的科学算力基础设施与镁伽承建的实验基础设施已双双落地孝感算力生态链产业园,在同一园区实现物理合体——算力产生的每一个仿真结果"下楼就能接受实验的检验",构成一条端到端打通的药物发现"高速公路"。双方立足 Poreva Open 推进三项落地合作:

⚡

赛事科学算力支持

思朗科技作为 Poreva Open 联合发起方,为参赛团队提供科学算力资源支持,降低全球创新团队的参赛门槛。10.18 公布的 FAQ 已落地一项具体支持:可选的分子动力学(MD)设计评估——对候选分子做动态检查,看结构是否立得住、结合是否保得住;非必需,有意团队可致函 userservice@yangtze3d.com。

联合发起方
🔬

物理仿真与湿实验互证

依托思朗「天穹」3D 科学计算机对大赛产出的候选分子开展分子动力学深度研究——AI 给出设计、计算验证结构、实验验证生物,三重互证;研究数据遵循大赛数据开放政策。

MD 深度研究
🔄

双数据底座共建

湿实验数据与仿真数据双向流动,共同反哺蛋白质设计科学模型的持续迭代,形成「干湿闭环」的数据飞轮。

数据飞轮

办赛机制:三个统一 + 四项原则

以「统一赛题、统一实验体系、统一评价标准」让所有模型和设计路线在同一实验基准下横向比较,并在正式提交前公开及冻结核心规则,遵循四条原则:

📏

规则赛前冻结

赛题、实验协议、评分规则在设计提交前公开,减少规则变化对参赛结果的影响。

提交前公开
🔒

实验双盲进行

参赛设计和实验执行环节进行信息隔离,降低人为因素对实验过程和结果判断的影响。

信息隔离
📂

开放成功与失败数据

在知识产权与合规要求允许的范围内,统一整理实验样本、结果及相关数据并逐步向社区开放——失败数据同样纳入体系,帮助研究者了解不同设计方法的边界。

含阴性结果
🧭

独立参考队伍

镁伽科技及产业合作方相关团队将参与赛事并作为参考队伍独立排名,不占用参赛团队的奖项及合作机会。

不占奖项名额

评价维度:六项官方指标 + 分层实验验证

10.18 发布的评价体系给出六项官方验证维度:结合亲和力、热稳定性、物种交叉反应(临床前物种直系同源靶点结合)、特异性结合(对非目标蛋白无可检测结合)、pH 选择性结合、细胞功能(激活/阻断等功能活性)。在基础实验验证之外,排名领先的设计将进入更复杂的生物学验证体系,在类器官等更接近真实生理环境的模型中接受进一步评价——比赛关注的不只是能否实现预期结合,还包括在更真实生命体系中的功能表现与作为潜在药物候选物的开发价值。首轮三题的指标组合已经坐实主线:条件化与功能性优先于静态亲和力。

赛制时间线

2026.09.22
赛事正式对外宣布发起(镁伽科技)
2026.10.13
思朗科技×镁伽科技宣布战略合作,思朗成为赛事联合发起方并提供科学算力支持
10.18 – 11.18
团队报名注册(与首轮提交流程并行);10.18 首轮三题(EGFR / TNF-α / GLP1R)正式发布
10.19 – 11.18
首轮序列提交窗口(平台到时自动关闭,逾期不受理;按提交顺序验证、容量有限先到先得)
11.19 – 11.25
首轮入选序列确认;11.26 公布入选设计清单
11.08 – 12.16
第二轮 C4–C5:11.8 发布题面,11.9–12.8 提交,12.9–15 确认,12.16 公布入选
2026.12 – 2027.03
入选设计进入 Megalaxy Lab 自动化平台统一湿实验验证(蛋白表达、纯化、结合检测、细胞功能、类器官一条可追溯管线)
2027.04
验证结果在 Poreva Open 平台公布;单项检测如遇技术困难可能延期或复测,变更经平台公告

实验平台与长期定位

  • 全部实验验证在 Megalaxy Lab 镁伽鲲鹏实验室完成:高通量规模化蛋白表达、纯化、结合检测、细胞功能评价与类器官实验能力,在统一实验条件下完成万级设计的标准化验证
  • 样本、实验过程与数据结果全过程追踪,支撑万级设计的标准化验证;随参赛规模扩大持续积累"设计策略—实验结果"对应关系,为模型训练与方法改进提供数据基础
  • 三层长期价值:建立可信实验基准、沉淀高质量开放数据、发现真正具有科学和转化潜力的分子与团队;每届引入新靶点、新设计任务与新评价维度,让不同代际模型在真实实验条件下持续比较
  • 官方定位:成为"蛋白质智能进入真实世界之前的一层公共实验评价基础设施";赛事报名及详细信息经镁伽科技微信公众号陆续发布
  • 发起方镁伽科技为国内领先的自主智能体(Autonomous Agent)提供商,聚焦智慧实验室与智能制造场景
  • 联合发起方思朗科技为联和投资公司投资企业,自主芯片与整机起家,「天穹」3D 科学计算机面向分子动力学等高强度科学计算;其科学算力设施与镁伽实验设施同驻孝感算力生态链产业园
赛事官网(Poreva Open · 报名与提交平台) C1: EGFR 题面与 FAQ C2: TNF-α 题面与 FAQ C3: GLP1R 题面与 FAQ 赛事官方公众号原文(微信) 查看苏州工业园区官方报道(9.22 发起) 查看上海市国资委报道(10.13 思朗×镁伽合作)
SICBC · 第三届 · 🇨🇳

2026上海国际计算生物学创新大赛

Shanghai International Computational Biology Innovation Challenge

主办方:上海市生物医药科技产业促进中心 指导:上海市科委 报名截止:2026.08.09(小分子)/ 07.26(抗体)

赛事概览

2026上海国际计算生物学创新大赛(SICBC)于6月25日在浦东正式发布并全面启动,这是大赛连续第三年举办。赛事紧扣上海计算生物学创新发展布局,建立"AI设计—实验验证—反馈优化"的闭环机制,不只关注模型在历史数据集上的表现,更强调计算结果能否真正进入湿实验验证。面向全球科研团队、企业研发团队、高校师生及创新主体开放招募,决赛将于2026年12月举行。

两条赛道

💊

小分子设计赛道

靶点为HSV DNA聚合酶(HSV Pol),要求利用AI与计算生物学方法筛选非核苷类小分子抑制剂,需同时抑制野生型及三种耐药突变体(W781V、N815S、Y941H)。指定化合物库约1000万分子,每队提交100个排序分子。

HSV Pol · 抗病毒
🧬

抗体设计赛道

靶点为PVRIG(CD112R)免疫检查点,目标是设计高亲和力、高特异性抗体分子阻断PVRIG与PVRL2结合,解除肿瘤免疫抑制。接受IgG单抗和VHH纳米抗体,CDR与已知阳性参考抗体序列相似度须低于80%。

PVRIG · 肿瘤免疫

赛制流程(小分子赛道)

2026.06.25 — 08.09
报名阶段:提交方案摘要 + 100个排序分子,主办方筛选最多100支队伍入围
2026.08中 — 11中
初赛:TSA热位移初筛(ΔTm≥2°C)→ IC50功能验证 → 前10名晋级复赛
2026.11中 — 11底
复赛:三种耐药突变体IC50再评价 + WT互作评分,提交源代码,前5名晋级决赛
2026.12
决赛:现场答辩,湿实验得分(70%)+答辩得分(30%)加权排名

奖金设置(每条赛道相同)

奖项名额奖金(税前)
一等奖1队¥100,000
二等奖2队¥30,000/队
三等奖2队¥20,000/队
优胜奖5队¥10,000/队

赋能政策

  • 优先推荐:获奖团队可直通上海市相关科技计划与产业扶持资源
  • 场景合作:对接领先生物医药企业与联合研发机会
  • 转化支持:专利申请辅导、创业指导、投融资对接一站式服务
  • 学术发表:支持赛事成果在同行评审期刊发表
  • 人才发展:核心成员纳入"人才推荐白名单",获定向实习与优先录用权益

关键参考信息

小分子靶点
HSV Pol (Cell, 2024)
抗体靶点
PVRIG / CD112R
抗体PDB参考
8X6B, 9E6Y
化合物库规模
~1000万分子
战略合作伙伴
上海银行
联系邮箱
SICBC@phaimus.com
访问赛事官网
FBS / FRCBS · 清华大学 · 🇨🇳

Frontiers in Biological Structures:清华FBS赛事平台

北京前沿生物结构研究中心 · 国际结构生物学会议、工作坊与竞赛

主要组织方:北京前沿生物结构研究中心(FRCBS) 依托单位:清华大学 所在地:北京 · 清华大学校园

组织方定位

FBS(Frontiers in Biological Structures)是由北京前沿生物结构研究中心(FRCBS)组织的国际学术会议、工作坊、讲座与竞赛系列。FRCBS成立于2018年,依托清华大学开展结构生物学研究,重点覆盖生物大分子机器、疾病相关膜蛋白、肿瘤抑制因子、冷冻电镜技术、AI驱动的新型生物结构技术,以及基于结构的药物发现与开发。

FBS官网将会议与竞赛作为同一学术平台运营,为中国的AI4Science赛事生态补充了结构生物学和蛋白/肽段设计方向的国际组织方。官网公开信息显示,FBS活动已覆盖生物、化学、物理、神经科学及其交叉领域,并在清华大学举办。

代表性赛事:Peptide Design Competition → PDC2026

FBS 平台 2026 赛季已上线:Protein Design Competition 2026 要求设计无天然配体即可激活 NK2R 的纳米抗体激动剂,提交窗口 2026.09.24–11.11,详见本页上方 PDC2026 卡片。

🧬

计算肽段设计

FBS官网设有Peptide Design Competition页面,公开结果表包含候选肽序列、设计方法和多项评分,适合比较扩散模型、进化算法及自定义集成方法在肽段设计任务中的表现。

肽段设计 · 结构生物学
🧪

计算—实验衔接

赛事结果页面同时提供与合成筛选相关的公开结果资源,使计算候选物、排序指标和后续实验验证之间形成可追踪的连接。

候选排序 · 实验验证

适合参赛的团队

  • 蛋白质/肽段生成模型、扩散模型和序列设计团队
  • 结构生物学、冷冻电镜和生物信息学研究团队
  • 希望将AI候选设计推进至合成与实验验证的高校、研究所和产业团队

官方入口

组织方主页
FBS Conferences & Competitions
研究中心
FRCBS · Tsinghua University
平台统计
120+会议 · 20,000+参与者 · 10+国家
PDC2026 进行中:NK2R纳米抗体激动剂赛 → 访问FBS官方平台 查看FRCBS组织方介绍 查看Peptide Design Competition结果
WSAI · 第四届 · 🇨🇳

第四届世界科学智能大赛

World Science AI Competition · AI4S智能体CNS挑战赛

主办方:上海科学智能研究院 × 复旦大学 参赛规模:32国 17,977名选手 奖金池:百万级

赛事概览

第四届世界科学智能大赛首创AI4S智能体CNS挑战赛,将竞技对象从科学领域算法模型拓展至自主科研智能体(Autonomous Research Agent)。参赛智能体需在零人工干预条件下,独立完成文献理解、代码重构、假设提出、实验验证与结果迭代,并挑战CNS等顶级期刊已发表成果的当前最优水平(SOTA)。大赛同时设有四大算法赛道,独家开放实测数据集与高精度仿真系统。

五大赛道

🤖

AI4S智能体CNS挑战赛

四大任务:DrugClip高通量虚拟筛选优化、靶向分子设计与逆合成规划闭环、蛋白质构象系综生成、神经算子自动改进。要求智能体零人工干预完成科研全生命周期闭环。

自主科研Agent
⚡

可控核聚变赛道

依托新奥玄龙-50U球形环装置高精度仿真环境,聚焦托卡马克聚变装置位形控制。采用强化学习在线实时交互训练模式,晋级队伍可进入实体装置实验室上机实测。

强化学习 · 在线交互
📊

电力市场交易赛道

接入内蒙古电力交易中心一手实测数据,直击新能源并网波动大、负荷预判难等痛点,以行业刚需驱动技术创新。

实测数据 · 产业一线
🧬

生物结构预测赛道

瞄准RNA–蛋白复合物三维结构预测的瓶颈,引导选手融合AI技术搭建智能建模框架,突破现有结构预测方法的局限。

RNA-蛋白 · 结构预测
📜

古文字识别赛道

开放复旦大学出土文献与古文字研究中心独家整理的权威数据集,要求破解复杂背景、风化噪声、字符粘连等难点。

独家数据 · 文字识别

赛制时间线

2026.03.01 — 05.31
报名组队及初赛:排行榜成绩作为初赛成绩,TOP50团队提交代码审核,前35名晋级复赛
2026.06
复赛:关注智能体在无人值守环境下的工程鲁棒性与跨场景迁移能力
2026.07
决赛:五大赛道共计50支队伍晋级决赛,百万级奖金池角逐

赛事亮点

  • 全球首创AI4S智能体CNS挑战赛,竞技对象从算法模型升级为自主科研智能体
  • 32个国家与地区近1.8万名选手参赛,涵盖清华、北大、帝国理工、南洋理工等高校
  • 评审委员会包括复旦大学校长金力院士、龚新高院士等多位CNS级科研成果学者
  • 引入OPC(One-Person-Company)孵化机制,探索"以赛育企"科创转化新路径
  • 提供各大主办及合作单位的优质就业对接通道与产学研合作机会
查看赛事详情
JUMP AI · 🇰🇷 · 报名/初赛中

第4届 AI 新药开发竞赛(JUMP AI / fourth.py)

4th AI Drug-Development Competition · 按研发阶段设计 Agentic AI

主办:韩国保健福祉部 × 韩国保健产业振兴院(KHIDI) 协办:韩国制药生物协会、高丽大学医学院/BK21 主题:按药物研发阶段的专用 AI Agent 设计与实现

赛事概览

第4届 JUMP AI 将竞赛重心从单点模型迁移到agentic AI:参赛者需针对药物研发全流程中的真实痛点,设计能自主设定目标、调用工具并闭环迭代的智能体方案。参赛资格面向大韩民国境内个人或不超过3人团队。AnySearch 检索到 KHIDI 官方通报与相关报道(2026-06-29/30)。

四类命题方向

🧠

自主假设生成与验证

围绕靶点/机制/适应症提出可检验假设,并构建文献—数据—实验规划闭环。

Hypothesis Agent
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工具驱动分子优化环

对接对接、生成模型、ADMET 等工具,形成“设计—评分—再设计”的分子优化 Agent 循环。

Molecule Optimization Loop
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监管响应与智能临床设计

面向 IND/临床方案、法规材料与试验设计智能化,强调可审计与合规输出。

Regulatory · Clinical Design
🔗

综合/跨阶段集成

跨多个研发阶段整合 Agent 能力,强调工程可部署性与产业对接价值。

Integration

赛制时间线

2026.06.29 — 08.07
初赛/提案提交与书面评审(约 10–15 队晋级本赛)
2026.09.07 — 10.02
本赛实现期;晋级队获 API credit 支持
2026.11.06 前后
最终颁奖与产业对接;约 10 队获奖

奖金(公开报道口径)

奖项奖励
大奖 / 保健福祉部长官奖₩10,000,000
优秀奖 / KHIDI 院长奖₩5,000,000
优胜奖(协会长/医学院院长等)₩3,000,000
鼓励奖₩2,000,000
赞助奖₩1,500,000
KHIDI 官方通报 英文报道摘要

🌍 美国 / 国际赛事

美国与国际AI4Science赛事以盲测挑战(Blind Challenge)为核心范式,强调模型在未见数据上的泛化能力与实验验证的严格性。

Anthropic×Adaptyv · 🇺🇸 · C2 TNF-α / C3 GLP1R 双题开放中

Anthropic × Adaptyv Protein Design Competition 2026

五连挑战 · 5,000+ 设计进入自动化湿实验验证 · 全量数据 ODC-BY 开放

主办方:Anthropic × Adaptyv(Proteinbase 平台;协作:Twist / Modal) 投入:$1M+ Claude 额度 + $1M+ 湿实验验证 周期:2026.09.28 — 11.08(每周一释题,两期窗口重叠)

赛事概览

迄今规模最大的公开蛋白设计验证赛事:不设现金奖,筹码是算力与湿实验——入选设计全部进入 Adaptyv 自动化实验室合成表征,序列、结构、方法、实验数据(含阴性结果)以 ODC-BY 许可公开于 Proteinbase。遴选由 Anthropic 与 Adaptyv 预写的 Claude 工作流执行(提示词不公开,防指标过拟合),方法新颖性计入遴选维度;提交材料中的 prompt injection 可直接判出局。

三轨参赛制

🏢

Track 1 · 实验室/公司

学术队最高 $50k、产业队 $25k Claude 额度;约 30 队;每题预留 ~15 个测试名额。申请已截止。

每题提交 20–40 个设计
👤

Track 2 · 个人/≤3 人小队

需机构隶属;获 Claude Max 20x 赛期使用权;测试名额不保证。申请已截止。

每题至多 20 个设计
🌐

Track 3 · 开放轨

自备工具与算力、Claude 可选;经同一遴选流程考虑测试。当前唯一仍开放提交的入口——但受下方 Section 3.1 资格条款约束。

注册 Proteinbase 即可提交

资格红线:Section 3.1 禁赛名单(中国居民/实体不可参赛)

首页写着「Open to everyone and free to enter」,但官方条款 Section 3.1对全部三轨统一设限:参赛者不得为 Belarus、China、Cuba、Iran、Myanmar、North Korea、Russia、Sudan、Syria、Crimea 及所谓 DPR/LPR 等司法辖区的合法居民或注册实体,且不得为美国及其他适用出口管制、制裁或类似法律禁止的对象。换言之,中国居民与中国注册实体按条款不可正式参赛,开放轨也不例外——对本站读者,该赛事的合理姿势是跟踪题面方法学、遴选机制与次年 1 月的 ODC-BY 开放数据,而非提交设计。

  • 每轨测试配额(5.4):Track 1 每队每题至多约 15 个预留测试名额;Track 2 与 Track 3 各至多一个 384 孔板(含对照),由预写的 Claude 遴选工作流决定——与"每题约 1,500 个设计进湿实验"的总口径自洽
  • 生物安全筛查(5.5):每个进入湿实验合成的设计在 DNA 合成前执行标准生物安全筛查;主办方可拒收或取消资格且无义务解释理由
  • 准入对照:同周开闸的中国赛事口径相反——长江杯不设地域限制(报名至 10.31),Poreva Open 面向全球、不限模型与技术路线;Anthropic 一侧按注册地设限,而实验数据承诺向所有人开放,构成 2026 年蛋白设计赛事的"准入—数据"光谱两端

Challenge 1 · 条件化 EGFR binder(9.28–10.7,已截止)

设计针对人源 EGFR 胞外区(建议 domain III 功能表位,PDB 6ARU——西妥昔/帕尼单抗同表位)的 binder,三目标须同时成立,且排名优先级为 pH 选择性 > 小鼠交叉反应 > 亲和力——官方明确"弱但明确 pH 敏感的 binder 可能比高亲和力但不敏感者更具影响力",本质是鼓励攻克条件化开关而非刷亲和力:

  • 结合人源 EGFR 完整胞外区(亲和力,建议功能表位以保治疗相关性)
  • 同一序列兼结合小鼠 EGFR(省去临床前鼠模型单独开发 binder)
  • pH 6.5 结合 / pH 7.4 无可检测结合(肿瘤微环境条件化,对应 His 类 pH 感应元件设计)

Challenge 2 · 条件化 TNF-α binder(10.5–18)

设计针对可溶性 TNF-α 三聚体(PDB 1TNF;三个受体结合位点位于亚基界面,即阿达木单抗/英夫利昔单抗的中和表位)的 binder。人/鼠可溶性域 79% 同源,两构建体均以三聚体形式供测(SEC-MALS 约 45–62 / 50–65 kDa),每个靶点呈递三拷贝表位。同样三目标,但 pH 开关方向与 C1 相反:

  • 结合人源 TNF-α 三聚体(亲和力)
  • 同一序列在 pH 7.4 下兼结合小鼠 TNF-α
  • pH 7.4 结合 / pH 6.0 释放——模拟血浆中结合、酸化早期内体中释放:binder 放开抗原后抗原被清除、binder 可循环再用,是延长抗体药物半衰期的成熟工程策略

Challenge 3 · GLP1R 激动剂(10.12–25,当前开放)

前两题用可溶性靶点考"条件化结合",C3 升级为膜受体的功能激活:人源 GLP1R(七次跨膜 GPCR,司美格鲁肽/替尔泊肽的靶点)以 DDM/CHS 去垢剂中受体形式供给(PDB 6X18,残基 24–432 覆盖胞外域 + 7TM + 胞内段首部;供应构建体带 FLAG/His 标签及未公开的热稳定突变)。两目标、不设物种与 pH 条件:

  • 结合人源 GLP1R(建议胞外域肽结合槽功能表位——GLP-1、exendin-4、semaglutide 的对接位)
  • 必须是激动剂:只结合不激活不计分——确认结合的 binder 进入细胞功能实验(细胞表面表达 GLP1R + cAMP 响应元件驱动分泌型碱性磷酸酶报告基因;激活 → Gαs → cAMP 升高 → 报告酶发光读出,与未处理细胞和参考激动剂对照)

排序维度:亲和力 → 功能激活确认。这是出题轴心的第二次加码:从"在对的 pH 结合"升级为"让受体真正工作"。

Challenge 4 / 5(题面待公布)

  • C4:10.19–11.1;C5:10.26–11.8(均周一释题,窗口第二周周日 23:59 AoE 截止)
  • 官方 FAQ 曾透露后续题目含 peptide–MHC(测脱靶方向);C1/C2 的条件化开关 + C3 的功能激活已坐实主线——选择性、条件化、功能性,而非静态亲和力

评奖按五类分子分层:minibinder(40–100 aa)、大蛋白(>100 aa)、microbinder(<40 aa)、纳米抗体、抗体(scFv/Fab);各题按类别分别评奖。

提交规范与硬性筛选

  • CSV 格式:按你的排序自上而下(首行最佳),至少含 name / sequence / molecule_class(protein、nanobody、scfv、fab_kappa、fab_lambda);Fab 以 "VH:VL" 单序列提交
  • 数量:Track 1 每题 20–40 个;Tracks 2/3 每题至多 20 个
  • 硬筛:单链 10–250 aa;纳米抗体/抗体以 ANARCI 类工具注释为准(建议常见 framework);序列唯一;必须 de novo + zero-shot——不得从既有 binder 出发改造,需与已知蛋白保持足够序列/结构多样性(抗体看 CDR 多样性);可用已知 binder 校准指标或微调模型但不能以其为起点
  • 附加材料(强烈建议):预测指标(ipTM、ipSAE、自洽性、物理指标、liability 分数)、结构模型、方法学与 provenance,可挂 Drive/GitHub 链接——Track 2/3 遴选会把这些信息一并交给 Claude 判断

遴选机制:Claude-as-judge

每题约 1,500 个设计进湿实验(Track 1 50%、Track 2/3 各 ~25% 即 ~375 个)。Track 1 通过硬筛后取 CSV 前 20 个(排序方法直接决定被测对象);Track 2/3 的全部合格设计与所附信息打包给 Claude,由 Anthropic 与 Adaptyv 预写的选择提示词按"预测质量 + 设计新颖性 + 方法新颖性"挑选——选择 prompt 刻意不公开,防止围绕单一指标过度优化;在提交材料中嵌入指令或 prompt injection 可直接判取消资格。这是公开赛事中少见的 LLM-as-judge 选样设计:方法文档的严谨度本身就是竞争力。

数据开放与 IP

  • 参赛者保留设计所有权;被测设计的序列、预测结构、方法、实验数据(含阴性结果)以 ODC-BY 许可公开于 Proteinbase
  • 允许匿名提交(匿名 Proteinbase 账号,事后可解除)
  • 工具自由:任何合法获取的工具可用(开源折叠/设计模型、内部工具均可;商业许可需自备);官方推荐其推理优化模型栈(uplifting-biomolecular-modeling)
  • 未用完的 Claude/Modal 额度赛末失效;Claude Max 约开赛三个月后到期

时间线

09.16–24
Tracks 1/2 资助申请(已截止)
C1 09.28–10.07
EGFR 条件化 binder(已截止)
C2 10.05–10.18
TNF-α 条件化 binder(pH 方向与 C1 相反)
C3 10.12–10.25
GLP1R 激动剂(开放中,须功能激活)
C4 10.19–11.01
题面待公布
C5 10.26–11.08
题面待公布
至 12.07
入选设计进入 Adaptyv 自动化实验室湿实验验证
次年 1 月初
全部实验数据(含阴性结果)于 Proteinbase 公开

战术解读

  • 本质是"条件化设计"的公开大考:跨物种交叉 + pH 开关对应 binder 设计真实痛点——亲和力已非瓶颈,"在对的条件结合"才是;pH 选择性对应界面组氨酸类感应元件的质子化耦合
  • 提交排序即策略:Track 2/3 仅 ≤20 个名额且由 Claude 遴选,CSV 排序与 methods 文档清晰度实质影响入选率——把 pH 响应逻辑与 novelty 论证写进材料比多刷未解释序列更划算
  • 数据是稀缺公共品:对比 GEM×Adaptyv RBX-1 赛的 300 个测试,本次 ~5,000+ 且为条件化难题,次年 1 月首周全部数据(含失败)ODC-BY 可下载——不参赛也值得跟踪做基准与负样本分析
  • 中美坐标:与长江杯(¥100 万奖金、纳米抗体+湿实验)、PDC2026(NK2R 激动剂)同周开赛;本赛特点是无奖金、重开放数据、LLM 深嵌赛事流程(额度激励+遴选评审);资格端则相反——条款 3.1 对中国居民/实体设限,而上述中国赛事均不设地域门槛
  • 镜像基准(10.18 更新):镁伽×思朗 Poreva Open 同日发布的首轮三题与本赛 C1–C3 高度同源——同样的人/鼠 EGFR 条件化 binder(6.5 结合/7.4 不结合)、TNF-α 三聚体 pH 7.4 结合/6.0 释放、GLP1R 去垢剂受体激动剂,连同分子类别、de novo 硬筛、CSV 排序提交与 prompt-injection 出局条款都一致;区别在赛制(Poreva 仅团队 ≥3 人、24 条/题、约 2000 条/题湿实验、¥170 万现金奖池+投资意向)与资格(面向全球)。同一题面在两条自动化实验线上的平行结果,将是 2027 年最有价值的跨平台对照数据。详见上方 Poreva Open 卡片
赛事官网(Proteinbase) Challenge 1: EGFR 题面与 FAQ Challenge 2: TNF-α 题面与 FAQ Challenge 3: GLP1R 题面与 FAQ 官方竞赛条款
CASP17 · 🇺🇸 · 进行中(预测季)

CASP17: 第17届蛋白质结构预测关键评估

17th Community Wide Experiment on the Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction

主办方:Protein Structure Prediction Center (UC Davis / NIH) 周期:2026.04.27 — 2026.08(预测季) 状态:注册291组(专家217 + Server 74),提交约5.9万模型

赛事概览

CASP是蛋白质结构预测领域最权威的盲测评估实验,自1994年起每两年举办一届。CASP16(2024)结果显示深度学习方法在某些关键领域出现性能平台期。CASP17的核心目标是催化深度学习尚未突破、且具有重大实际应用意义的领域的进展。规则简述:"如果AlphaFold3能生成高质量模型,那它就不是CASP级别的挑战;如果AF3也束手无策,那就是我们需要的。"

目标类别

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免疫复合物

当前深度学习方法的重大失败领域。需要抗体-抗原、纳米抗体-抗原、T细胞受体复合物等非同源靶标集。

抗体-抗原 · TCR
💊

有机配体-蛋白复合物

对小分子药物开发具有显著重要性。CASP16显示深度学习方法常未达实验精度。需要3D蛋白-配体复合物和亲和力排序数据。

药物设计 · 配体结合
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核酸及其复合物

尽管声称已解决,CASP16和Kaggle挑战显示深度学习方法在缺乏同源结构信息时表现不佳。需要非同源RNA/DNA结构和蛋白-核酸复合物。

RNA/DNA · 蛋白-核酸
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构象系综

CASP的重大扩展领域。测试从离散构象到半无序态的结构系综计算方法。需要多构象高分辨率靶标和低温电子断层、SAXS、NMR等多分辨率数据。

构象系综 · 动态结构
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困难蛋白与复合物

膜蛋白、弱进化信息蛋白(病毒/寄生虫来源)、大分子复合物(>1000氨基酸)等当前深度学习方法的临界弱点。

膜蛋白 · 弱同源

关键时间线

2026.07.10
靶标征集截止(Call for Targets)
2026.09.01
实验坐标/数据交付截止(保密至评估结束)
2026年中下旬
预测提交窗口开放(约11周,已发布130+靶标)
2026年底
评估与CASP会议

实时规模(AnySearch · predictioncenter.org/casp17/numbers.cgi)

  • 注册组:291(专家组 217 + prediction servers 74)
  • 已发布靶标:蛋白无化学计量 70 + 有化学计量多聚体 59;RNA 44(含多聚 RNA 5);杂合靶标 8
  • 提交量(unique 组 201 / servers 67):约 13,564 个 model-1,总提交约 59,247
  • 分项:三级结构 12,377;异源组装 27,782;RNA 13,238;杂合复合物 2,681;精度估计 1,016
  • CASP16 引入配体系列;CASP17 继续双阶段,评审含 LDDT-PLI 与 BiSyRMSD;预测季 2026.04.27–08
CASP17 官网
CAPRI Round 65 · 🇪🇺 · 与CASP17联合

CAPRI Round 65:第7届联合 CASP-CAPRI 组装预测

Critical Assessment of PRedicted Interactions · Protein Assembly Blind Challenge

主办:EMBL-EBI / CAPRI Management 联合:CASP17 预测季(2026.04.27 — 08) 注册:2026.04.10 — 06.01

赛事概览

CAPRI 是蛋白质/大分子复合物对接与组装预测的权威盲测实验。Round 65 为第7届联合 CASP-CAPRI Assembly Prediction challenge,与 CASP17 同步:Server 与 Human predictor 均可提交,并在可能时提供 Scoring 挑战。官方页明确 CASP17 季自 4 月 27 日开启并持续至 2026 年 8 月。

参与方式

  • 同时参加 CAPRI + CASP:需分别注册两侧;CAPRI 注册时填写 12 位 CASP Team ID
  • 仅 CAPRI Scorer:只注册 CAPRI
  • 提交:通过 CAPRI gateway 提交最多 100 个模型(CAPRI 格式),前 10 排序;系统转发 top-5 至 CASP 评估
  • 与 CASP 抗体/组装难点互补:CAPRI 长期强化抗原-抗体与多组分组装评估

关键时间线

2026.04.10
Round 65 注册开放
2026.04.27 — 08
与 CASP17 同步的组装预测季
2026.06.01
Round 65 注册截止
CAPRI 官方门户 Round 65 详情
CACHE #8 · 🇨🇦/国际 · 报名进行中

CACHE Challenge #8:GID4 配体 Hit-Finding

Critical Assessment of Computational Hit-finding Experiments

托管:Conscience(原 SGC 发起) 靶点:GID4(CTLH E3 连接酶底物结合亚基) 申请截止:2026.04.30

赛事概览

CACHE 是面向计算化学/AI 药物发现的前瞻性 hit-finding 盲测:参赛者预测与疾病相关蛋白结合的小分子,由 CACHE 统一采购并做实验验证;命中发现轮后还有命中扩展轮。所有化学结构与实验数据公开、无使用限制。#8 聚焦 GID4 底物结合口袋(参考结构 6CCT 与 7SLZ),目标是发现可用于劫持 CTLH E3、推进靶向蛋白降解策略的新颖化学型。

赛制要点

  • 每约 4 个月启动新靶点;#8 申请截止 2026-04-30(官网展示)
  • Round 1:提名至多约 100 个可采购化合物 → 实验筛选
  • Round 2:基于实验反馈再提名扩展化合物
  • 评价:实验命中率、亲和力与理化性质、从汇总库挑选命中的能力
  • 与 SICBC/OpenADMET 互补:强调真实采购 + 双实验正交验证
靶点蛋白
GID4 / CTLH E3
结构参考
6CCT · 7SLZ
应用方向
TPD / 靶向降解
数据政策
全公开 · 无 IP 限制
CACHE 官网与当前挑战
GEM×Adaptyv · 🇺🇸 · 已结束

GEM×Adaptyv RBX-1 Binder Design Competition 2026

De Novo Protein Binder Design Against RBX-1 E3 Ubiquitin Ligase

主办方:GEM Workshop × Adaptyv Bio 结果公布:2026.04.26 @ ICLR Rio de Janeiro 湿实验验证:300个binder合成测试

赛事概览

GEM×Adaptyv RBX-1 Binder Design Competition 2026汇集计算蛋白质设计社区,挑战一个生物学意义重大但设计难度极高的靶标。参赛者提交从头设计(de novo)的蛋白binder序列,Adaptyv将300个设计在湿实验室合成并测试表达和结合亲和力。结果在ICLR 2026 GEM Workshop公布,所有参与者获得全部测试设计的实验数据和开源数据集。

靶点:RBX-1

RBX-1(RING Box Protein 1 / ROC1)是108个氨基酸的E3泛素连接酶组分,对SCF(SKP1-CUL1-F-box)复合物至关重要。参与细胞周期调控、信号转导和癌症生物学,在多种人类癌症中过表达。设计挑战在于:N端(1-39位)内在无序,C端RING-H2结构域由三个锌离子交叉支撑——柔性与刚性金属配位的组合测试当前设计方法的极限。

赛制与规则

  • 提交格式:CSV文件,包含排序的binder氨基酸序列(≤250 AA/条,≤100条/队)
  • 从头设计要求:不允许motif scaffolding或先导优化(单域抗体除外)
  • 序列新颖性:与UniRef50已知蛋白的最小编辑距离≥25%总序列长度
  • 抗体CDR:与SAbDab已知抗体的CDR编辑距离≥25%
  • 每队获得等量测试名额:300 ÷ 参赛队数

时间线

2026.02.15
提交开放
2026.03.26
提交截止(AoE)
2026.04.26
结果公布 @ GEM Workshop, Rio de Janeiro

奖金

奖项奖金其他
Best Designed Binder$1,000 USD3D打印蛋白结构模型
Runner-up$100 USD3D打印蛋白结构模型
所有参与者—实验数据 + 开源数据集 + 社区论文署名
赛事官网 Proteinbase 竞赛页与结果
OpenADMET · 🇺🇸 · 已结束

OpenADMET PXR Blind Challenge 2026

Pregnane X Receptor Activation Prediction · Activity & Structure Dual Track

主办方:OpenADMET × Octant × UCSF Fraser Lab 时间:2026.03.17 — 07.01 参赛者:350+研究人员

赛事概览

OpenADMET PXR Blind Challenge是AI药物发现领域最严格的盲测基准之一。PXR(孕烷X受体)是一种外源化合物传感器,可触发药物代谢。PXR诱导是药物发现中常见的liability,通常在后期先导优化中才被发现。该挑战赛发布了迄今最大、最一致的PXR诱导数据集——超过11,000个化合物的数据(来自Octant低成本高保真体外实验),包括4,000+化合物的完整剂量-响应数据。

双轨赛制

📊

活性预测赛道

传统表格数据预测任务,预测pEC50值。分两阶段:Phase 1有实时排行榜(Analog Set 1),Phase 2无实时排行榜(Analog Set 2盲测)。评估指标:MAE(越低越好)、Spearman ρ、RAE。

pEC50 · ADMET
🔬

结构预测赛道

预测配体在高度柔性的PXR结合口袋中的三维结构。评估指标:LDDT-PLI(越高越好)、BiSyRMSD(CASP15开发的对称校正配体RMSD)。184个小分子的X射线晶体结构作为评估基准。

3D结构 · 配体结合

时间线

2026.03.17
挑战赛启动
2026.04.01 — 05.26
Phase 1:实时排行榜(Analog Set 1评分)
2026.05.26
Analog Set 1数据解盲,参赛者可纳入训练
2026.05.26 — 07.01
Phase 2:无实时排行榜,Analog Set 2盲测
2026.07.14
最终排行榜公布:Inductive Bio获活性赛道第一(三连冠)

关键结果

  • 活性赛道冠军:matcha-croissant(MAE 0.4061),使用专有数据;非专有数据冠军为AIDD-LiLab(MAE 0.4092,佛罗里达大学Yanjun Li Lab)
  • 结构赛道冠军:willvith(LDDT-PLI 0.5302, BiSyRMSD 3.65Å)
  • Inductive Bio实现OpenADMET盲测三连冠(ASAP-Polaris + ExpansionRx + PXR),击败Merck(含NVIDIA)、Novo Nordisk、EMD Serono等大型药企
  • 累计750+参赛者,近10,000次提交,覆盖17个关键ADMET终点
  • 数据集:513个测试化合物(Set 1: 253 + Set 2: 260),11,000+训练化合物
查看结果
ASAP × Polaris × OpenADMET · 已结束

ASAP Discovery 抗病毒药物发现盲测挑战(2025)

Polaris Hub · Potency / ADMET / Ligand Poses 三子赛

主办:ASAP Discovery × OpenADMET × Polaris 靶点:SARS-CoV-2 / MERS-CoV Mpro 平台:polarishub.io

赛事概览

ASAP(NIH 资助的开源抗病毒联盟)在披露临床前候选前,与 OpenADMET、Polaris 共同发起面向真实药物发现数据的社区盲测,是 2026 OpenADMET PXR Challenge 的前序基准。

三个子挑战

🧩

Ligand Poses

由 SARS-CoV-2 Mpro 结构迁移预测 MERS-CoV Mpro 配体姿态;评估 <2Å 成功率与 RMSD。

Pose · Cross-virus
💊

Potency

预测双病毒 Mpro 活性,强调真实多终点决策而非单指标刷榜。

Potency · Mpro
📊

ADMET

MLM/HLM、KSOL、LogD、MDR1-MDCKII 等 5 终点(训练 434 / 测试 126)。

ADMET · 5 endpoints

为何仍重要

  • 数据集与评估逻辑已公开(含 unblinded ADMET 与 GitHub 评估代码)
  • 直接衔接 2026 OpenADMET PXR Blind Challenge
  • 方法比较使用 bootstrap + Tukey HSD / Compact Letter Display
Polaris 总挑战页 官方挑战说明博客
Owkin · 🇺🇸 · 2026.07.11–12 已举办

Owkin Rewiring Biology Hackathon

为 AI Scientist(K Pro)构建 MCP 工具与 Agentic 组件

主办:Owkin 地点:San Francisco · Trellis Coworking 规模:最多约 50 人 · 2–5 人跨学科队

赛事概览

两日黑客松:前沿 AI 如何在复杂生物数据上推理与行动。参赛者围绕 Owkin AI Scientist K Pro 开发 MCP 工具与多智能体工作流;可访问 MOSAIC Window、TCGA 与 API credits。申请截止约 2026-06-30。

挑战主题

  • Lab-in-the-loop 优化
  • 生物知识图谱与上下文映射
  • AI 驱动假设生成
  • 缩短实验闭环周期
  • 空间组学 + 基因组学多模态推理

奖项与结果线索

  • Best AI Scientist MCP / Frontier Award / Context Award
  • 公开复盘(2026-07-14):KScope、Discordance、Spatial Awareness
  • 与 WSAI AI4S Agent、韩国 JUMP AI 构成 2026 科研智能体赛道三角
官方活动页
9ADD · 🇨🇿 · 已结束

9th Advanced Drug Design Workshop Challenge

DYRK1B Virtual Screening Challenge · Olomouc 2026

主办方:Palacký University Olomouc (Czech Republic) 时间:2026.01.26—30 靶点:DYRK1B (PDB: 8C2Z)

赛事概览

第9届高级药物设计工作坊(9ADD)的竞赛环节,聚焦DYRK1B(双特异性酪氨酸磷酸化调控激酶1B)的虚拟筛选。DYRK1B在肿瘤学和非酒精性脂肪肝中是关键治疗靶点。参赛者从3,365个化合物的盲测库中选出100个最可能具有活性的DYRK1B抑制剂,排行榜以recall(召回率)排序。最佳预测将获得奖品并考虑进行化合物购买和实验验证。

赛制详情

  • 任务:从3,365个盲测化合物中选出100个最可能活性化合物
  • 活性定义:IC50/Ki/Kd ≤ 1µM 或 抑制率 ≥ 90%
  • 已知化合物:1,891个ChEMBL来源的标注活性/非活性分子(IC50: 745, Ki: 225, Kd: 41, Inhibition: 585)
  • 评分指标:recall(召回率),平分以提交时间排序
  • 每队最多10次提交,取最佳成绩
  • 个人或最多3人团队参赛

最佳提交结果参考

方法Recall说明
LGBM+CHEESE consensus0.67最佳:梯度提升+CHEESE嵌入共识
CHEESE ShapeSim (mean-cos)0.53形状相似性基线
CHEESE ESPSim (mean-cos)0.40静电势相似性基线
Ensemble (ESP+Shape, mean-rank)0.47集成排序
Morgan Fingerprint (Tanimoto)0.07传统分子指纹基线
挑战赛页面
Kaggle · 🇺🇸 · 已结束

Kaggle Gemma 4 Good Hackathon 2026

Gemma Life Sciences Challenge · AI for Drug Discovery & Precision Oncology

主办方:Kaggle × Google DeepMind 基础模型:Gemma 4 E2B / MedGemma / TxGemma 平台:Kaggle T4 GPU

赛事概览

Kaggle Gemma 4 Good Hackathon 2026的Gemma Life Sciences赛道,要求参赛者基于Google Gemma系列开源模型构建AI药物发现与精准肿瘤学应用。参赛项目涵盖从头药物分子生成、精准肿瘤学决策支持、药物-靶标文献智能检索等方向。该赛事的独特价值在于推动开源LLM在生命科学中的应用,所有模型可在Kaggle T4 GPU(16GB)上运行。

代表项目

💊

Gemma-Cure

基于Gemma 4 E2B的LoRA微调模型,在225K药物-靶标对上训练,生成药物样SMILES分子。SMILES有效率从0%提升至100%,平均QED达0.591。训练数据来源:BindingDB、ChEMBL、MOSES。

分子生成 · LoRA
🧬

Gemma-OncoExplorer

6阶段精准肿瘤学Agent流水线:MedGemma提取靶标基因→ChEMBL知识图谱检索→RDKit+XGBoost分子评估→TxGemma毒性预测→安全验证→临床报告生成。支持35+癌型、50+关键基因靶标,10分钟内生成可操作报告。

精准肿瘤学 · Agent
🔗

IdiotypeForge

从活检到个性化淋巴瘤治疗方案设计——mRNA疫苗肽段、设计抗体binder、CAR-T构建体。整合AlphaFold/IgFold + RFdiffusion + ProteinMPNN + OAS安全筛查,2小时内完成全流程,患者数据不离开本地。

个性化治疗 · RFdiffusion
📚

Drug-Target Literature Agent

本地部署的临床研究助手,使用Gemma 4(通过Ollama)搜索生物医学文献并合成带引用的摘要。查询和响应均不离开研究者机器。多源检索:Europe PMC、PubMed、ClinicalTrials.gov。

文献检索 · IP-safe

技术亮点

  • 开源LLM驱动:Gemma 4 E2B(5.2B参数)、MedGemma-4B、TxGemma-2B
  • LoRA高效微调:RS-LoRA rank 32,仅训练1.2%参数(62M/5.2B)
  • 4-bit量化(BnB NF4),Kaggle T4 GPU可运行
  • 训练数据规模:225,000药物-靶标结合对(BindingDB + ChEMBL + MOSES)
  • 评估指标:SMILES有效率、QED评分、复合分数
Kaggle赛事页面
Industry Conference

AI/ML for Early Drug Discovery

Drug Discovery Chemistry 2026 · AI/ML Part 2

时间:2026.04.15—16 地点:San Diego, CA 类型:行业会议 + 技术展示

会议概览

Drug Discovery Chemistry 2026的AI/ML分会场聚焦AI在药物发现中的深度应用,涵盖配体-受体对接与虚拟筛选、联邦学习、基因组学与遗传学、ADMET预测、生成式分子设计等方向。不同于学术竞赛的闭环验证模式,该会议更侧重产业落地与技术合作对接。

核心议题

  • AI驱动的配体-受体对接与高通量虚拟筛选
  • 联邦学习在跨机构药物发现中的应用
  • 基因组学与遗传学中的AI方法
  • ADMET预测与药物毒性评估
  • 生成式AI分子设计与从头合成规划
会议官网
Academic Challenge · 🇺🇸

Peptide Design Challenge

Science / AAAS 多轮计算设计验证竞赛

主办方:Science / AAAS 类型:学术竞赛 · 多轮迭代

赛事概览

由Science/AAAS组织的肽段设计挑战赛,采用多轮迭代验证模式:第一轮中候选肽段进行活性测试,第二轮基于第一轮结果进行优化并测试选择性。赛事核心价值在于揭示计算预测与实验结果之间的对齐程度——即"预测-实验"差距,为AI蛋白质/肽段设计方法的实验验证提供了标准化基准。

赛事特点

  • 多轮迭代设计:第一轮结果指导第二轮优化,模拟真实药物设计流程
  • 选择性测试:第二轮评估候选分子在同源家族蛋白间的选择性
  • 预测-实验对齐分析:系统评估计算方法的可靠性与适用边界
  • 发表在Science期刊,具有高学术影响力
阅读详情
Industry Context

2026 全球AI制药产业格局

从模型创新到大规模资本投入与产业突破

关键产业事件

2026.01
英伟达与礼来宣布未来五年最高投入10亿美元建设AI药物发现联合实验室,推动基础模型、加速计算与物理AI进入药物发现流程
2026.05
谷歌DeepMind旗下Isomorphic Labs完成21亿美元B轮融资,全力升级AI药物设计引擎和候选药物管线
2026.06
英矽智能与韩国SK生物制药达成AI驱动药物研发合作,潜在交易总金额超过25亿美元
2026.06
BIO 2026大会AI Summit:从Agentic AI自主决策到生成式基因组学,七大趋势定义AI+Science分水岭

赛事参与建议

  • 小分子赛道:关注多构象动力学建模与耐药突变体联合抑制策略,化合物库筛选+从头设计混合方案
  • 抗体赛道:重点解决胞外域小、表位有限的挑战,利用OAS/PLAbDab数据库进行CDR从头设计或优化
  • 智能体赛道:构建"生成-评测-优化"闭环迭代体系,关注多智能体协作与自动化合规审查
  • 跨赛道通用:重视可复现性(源代码提交)、创新性(与开源方法区分)、以及实验验证导向的设计思路

参赛资源与工具

📚

抗体数据库 OAS

Observed Antibody Space

📋

专利抗体库 PLAbDab

Patent & Literature Antibody DB

🧪

纳米抗体库 INDI

Integrated Nanobody Database

🔬

蛋白结构 PDB

RCSB Protein Data Bank

💊

化合物库

SICBC指定1000万分子库

🔗

UniProt

PVRIG: Q6DKI7 / PVRL2: Q92692

📐

RDKit

开源化学信息学工具包

🤖

RFdiffusion

从头蛋白质/binder设计

🧬

AlphaFold3 / Boltz2

蛋白-配体复合物结构预测

📊

ChEMBL / BindingDB

药物-靶标结合活性数据库

🎯

CHEESE Embeddings

分子静电势/形状相似性嵌入

🧪

ProteinMPNN

蛋白质序列逆折叠设计

💡

Gemma 4 / MedGemma

Google开源生命科学LLM

🧫

Adaptyv Bio

高通量蛋白质湿实验验证平台

🌐

OpenADMET

开放ADMET预测基准与数据集

🧭

Polaris Hub

药物发现盲测与基准平台

🎯

CACHE Challenges

计算 hit-finding 实验验证闭环

🤝

CAPRI / EMBL-EBI

复合物对接与组装盲测

🧾

Proteinbase

GEM×Adaptyv 开放实验数据

结果更新(2026.04 湿实验后)